Live-action avonturenfilm gebaseerd op de gelijknamige kinderboeken waarin drie kinderen een geheimzinnig boek ontdekken

Mallory en haar tweelingbroers Jared en Simon verhuizen met hun moeder naar Villa Spiderwick, een groot huis van hun tante. De kinderen ontdekken al snel een geheime bibliotheek in huis waar een geheimzinnig boek wacht. Ze ontdekken ook dat er nog iemand in huis is, een kleine kobold die hen het leven zuur maakt door Simons kikkervisjes in te vriezen, zijn muizen te laten ontsnappen en Mallory's haar aan haar bedeinde vast te knopen. Ze proberen de kobold gunstig te stemmen door een nieuw huisje voor hem te maken, het oude hadden ze kapot gemaakt. Als dank voor zijn nieuwe huisje geeft hij hen een waarschuwing: verbrand het geheimzinnige boek. Maar dat kunnen ze niet...